Un muy buen listado de programas open-sorce (gratuitos, código abierto, libres) para windows en el wiki de Ubuntu “LoopList” (List Of Open-source Programs (LOOP) for Microsoft Windows Operating Systems.
Software libre para Windows (y gratuito) que en muchos de los casos son los mejores de la categoría, se menciona el mejor en cada aspecto.
En lo personal, en el winbugs tengo instalados muchos de ellos, los que no es por que no los necesito 
listas similares
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The OSSwin project: Open-Source para Windows
http://osswin.sourceforge.net/ -
Opensource list – Open Source para entornos Windows
http://www.opensourcelist.org/oss/suggestedapplications.html -
Software: Open Source & Free para Windows
http://www.alessandropagano.net/software_en.html -
tabla de equivalencias / remplazos / analogos Windows – Linux
http://www.linuxrsp.ru/win-lin-soft/table-eng.html -
Open Source Software CD — Lista de Software
http://osscd.sunsite.dk/list.html -
WinLibre – Software libre para Windows
http://www.winlibre.com/en/index.php -
GnuWin32 – Portados de GNU o Open Source tools
http://gnuwin32.sourceforge.net/ -
Open source on Mac
http://nothickmanuals.info/doku.php?id=opensourcemac
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